¿Por qué la orina tiene olor desagradable?

La orina es el producto del filtrado de la sangre por medio de los riñones.
Ésta se compone de diversas substancias denominadas "de desecho", entre las cuales se pueden contar: urea, ácido úrico, creatinina, etc.
Normalmente ésta suele ser "limpia" cuando sale del organismo. Sin embargo, el origen del asco que se le tiene es debido a su característico olor. La razón del mismo se debe al carbonato neutro de amonio que contiene, el cual tiende a ser ligeramente amoniacal. (No confundir con el carbonato ácido o bicarbonato de amonio, el cual se utiliza como leudante).
Cabe destacar que cuando el olor es muy pronunciado puede ser debido a bacterias (infección renal o vesical) o a altas concentraciones de substancias como metilamina (lo que le confiere un olor a amoníaco o "tinte de pelo" -dicho más coloquialmente-).